Masalah yang disorot di Indonesia menurut catatan Amnesty International di laporan 2005 ini adalah: Pembebasan anggota GAM, penggunaan kekerasan yang berlebihan oleh anggota POLRI di Ruteng, Flores ketika terjadi demonstrasi, Penahanan Bambang Harymurti dengan kasus pencemaran nama baik dan penahanan aktivis di Maluku dengan tuduhan pemberontakan, Pembebasan pelaku pelanggaran ham berat kasus T…